Úkol:
- Uveďte hodnoty torzních úhlu φ a ψ pro ALA.
- Pomocí konvence trans/cis/gauche zapište konformaci páteře aminokyseliny ALA (například gauche(+), gauche(+)).
- Pomocí konvence (syn/anti) (klinální/periplanární) zapište konformaci páteře aminokyseliny ALA (například +sc, +sc).
- Do Ramachandranova diagramu zakreslete konformaci páteře aminokyseliny ALA.
Příklad 1:
(pdb)
Výsledky:
- φ=60°, ψ=-60°
- gauche(+), gauche(-)
- +sc, -sc
-

Příklad 2:
(pdb)
Výsledky:
- φ=±180°, ψ=0°
- trans, cis
- -ap (+ap), -sp (+sp)
-
