Úkol:

Dostali jste výsledky CD měření. V horní části jsou naměřená spektra typických konformací peptidu, v dolní části jsou spektra proteinu naměřená ihned po purifikaci a o dva dny později. Z uvedených interpretací výsledku uveďte tu, která odpovídá vašemu CD spektru.

1. Purifikovaný protein neměl pravidelnou strukturu, během doby mezi měřeními došlo k jeho vysrážení, takže koncentrace v kyvetě poklesla.
2. Purifikovaný protein měl strukturu β-soudku, během doby mezi měřeními došlo k částečnému vysrážení, takže koncentrace v kyvetě poklesla. Struktura proteinu v roztoku se ale nezměnila.
3. Purifikovaný protein byl tvořen svazkem α-šroubovic. Během doby mezi měřeními došlo k částečnému vysrážení, takže koncentrace v kyvetě poklesla. Struktura proteinu v roztoku se ale nezměnila.
4. Purifikovaný protein měl strukturu β-soudku, během doby mezi měřeními došlo k částečné denaturaci proteinu.
5. Purifikovaný protein byl tvořen svazkem α-šroubovic. Během doby mezi měřeními došlo k částečné denaturaci proteinu.
6. Purifikovaný protein byl tvořen dvěma β-doménami spojenými delší smyčkou bez pravidelné struktury. Mezi měřeními byla přidána látka, která vyvolala přeměnu smyčky na β-sandwich.
7. Purifikovaný protein byl tvořen dvěma β-doménami spojenými delší smyčkou bez pravidelné struktury. Mezi měřeními byla přidána látka, která vyvolala přemenu smyčky na dvě antiparalelní α-šroubovice.
8. Purifikovaný protein byl tvořen dvěma paralelními α-helixy spojenými dlouhou smyčkou bez pravidelné struktury. Mezi měřeními byla přidána látka, která vyvolala konformační změnu proteinu na strukturu α-β-α.
9. Purifikovaný protein byl přítomen ve své nativní α-šroubovicové formě. Mezi měřeními bylo přidáno malé množství patologické β-formy proteinu. Tento přídavek katalyzoval přemenu proteinu na formu skládaného listu.
10. Purifikovaný protein měl strukturu β-soudku. Zlomyslný kamarád vám ale vzorek mezi měřeními vyměnil za protein tvořený svazkem α-šroubovic.

Příklad 1:

Výsledky:

Příklad 2:

Výsledky:

Příklad 3:

Výsledky: