Úkol:

  1. Uveďte hodnoty torzních úhlu α, β, γ, ε, ζ a χ.
  2. Uveďte konformaci pentosového kruhu pomocí symbolu (například 1E).
  3. Uveďte konformaci pentosového kruhu pomocí konvence endo/exo (například C4'-exo).
  4. Uveďte hodnotu pseudorotační fáze pentosového kruhu.
  5. Uveďte, zda je nukleotid součástí molekuly DNA nebo RNA.
  6. Uveďte název báze nukleotidu (například adenin).

Příklad 1:

(pdb)

Výsledky:

  1. α=±180°, β=±180°, γ=±180°,
    ε=±180°, ζ=±180°, χ=-90°
  2. C2′-endo
  3. 2E
  4. 162°
  5. DNA
  6. thymin

Příklad 2:

(pdb)

Výsledky:

  1. α=±180°, β=±180°, γ=±180°,
    ε=-60°, ζ=-60°, χ=±180°
  2. C1′-exo
  3. 1E
  4. 126°
  5. RNA
  6. uracil