Úkol:

Určete sekvenci pentapeptidu (H-xxxxx-OH) z hmotnostního spektra, ve kterém jsou přítomny signály celého peptidu a všech y a b fragmentů krom b1, který nevzniká.

Příklad 1:

MS spektrum 1

Pozice píků

120.066 129.066 257.125 285.168 413.226 422.226 470.248 541.285

Výsledek:

H-Ala-Gly-Arg-His-Thr-OH

Řešení:

Mateřský iont MH+ H-Ala-Gly-Arg-His-Thr-OH + H+ 541.285

Fragment y4 = H-Gly-Arg-His-Thr-OH + H+ 470.248 protože 541.285 - 470.248 = 71.037 = zbytek Ala

Fragment y3 = H-Arg-His-Thr-OH + H+ protože 470.248 - 413.226 = 57.022 = zbytek Gly atd....

Fragment b4 = H-Ala-Gly-Arg-His+ protože 541.285 - 422.226 = 119.059 = zbytek Thr + H + OH

Fragment b3 = H-Ala-Gly-Arg+ protože 422.226 - 285.168 = 137.058 zbytek His atd ...