Úkol 1:

Přiřaďte naměřené rezonanční frekvence jader atomům páteře pentapeptidu Glu-Gly-Val-Glu-Ala. Při rozlišování Cα a Cβ si uvědomte, že s vyjímkou glycinu mají všechny aminokyseliny chemické posuny Cα v rozsahu 50 až 70 ppm.



protein NMR spektrum (HSQC)

protein NMR spektrum (HNCACB)

protein NMR spektrum (CBCA(CO)NH)
(pdf)

Vyplňte tabulku rezonančních frekvencí:

Aminokyselina δ 15N / ppm δ 1HN / ppm δ 13Cα / ppm δ 13Cβ / ppm
Glu 1        
Gly 2        
Val 3        
Glu 4        
Ala 5        

Výsledky:

Aminokyselina δ 15N / ppm δ 1HN / ppm δ 13Cα / ppm δ 13Cβ / ppm
Glu 1 - - 60 30
Gly 2 110 7.5 44 -
Val 3 120 9.5 58 32
Glu 4 125 8.5 62 34
Ala 5 130 9.0 52 20

Úkol 2:

Přiřadte naměřené rezonanční frekvence protonu vybraným atomům vodíku v dvojšroubovici DNA $\begin{array}{c} {\tt ^{5^\prime}GCTT^{3^\prime}}\\ {\tt ^{3^\prime}CGAA^{5^\prime}} \end{array}$



DNA NMR spektrum 1

DNA NMR spektrum 2
(pdf)

Vyplňte tabulku rezonančních frekvencí:

Nukleotid δ 1HN / ppm δ 1H6/H8 / ppm δ 1H1′ / ppm
G 1 12.0    
C 2      
T 3      
T 4      
A 1′   8.4  
A 2′      
G 3′      
C 4′      

Výsledky:

Nukleotid δ 1HN / ppm δ 1H6/H8 / ppm δ 1H1′ / ppm
G 1 12.0 8.2 5.4
C 2 - 7.0 6.2
T 3 14.0 7.4 5.2
T 4 13.0 7.8 4.8
A 1′ - 8.4 5.0
A 2′ - 8.0 5.6
G 3′ 13.5 7.6 5.8
C 4′ - 7.2 6.0